Vorlesung Grundlagen der Bioinformatik, 4. Stunde

Nieselt, Kay , 19.04.2012

Table of Contents:

00:00:00.0 Root (rho)
00:01:11.0 Tree Traversals, Exercises: Solution
00:03:01.0 Tree Traversals, isomorphic
00:04:24.0 Algorithm Techniques, Literature
00:05:28.0 Pairwise Alignment
00:08:37.0 Strings, Definition: Symbols and Alphabet
00:10:54.0 Strings, Definition: Concatenation
00:12:13.0 Strings, Definition: Substring
00:14:41.0 Strings, Definition: Reverse Complement
00:16:05.0 Strings, Definition: Reverse Complement (Example)
00:17:52.0 Sequence Formats, Single FASTA Format
00:22:28.0 Sequence Formats, Multiple-FASTA-Format
00:24:00.0 Dot Matrix Sequence Comparison
00:28:28.0 Dot Matrix Sequence Comparison, Definition: Dot Matrix
00:29:00.0 Dot Matrix Sequence Comparison
00:30:30.0 Dot Matrix Sequence Comparison: Window Size (Example)
00:33:11.0 Dot Matrix Sequence Comparison: Human LDL Receptor Protein (Example)
00:35:28.0 Dot Matrix Sequence Comparison: Limits of Dot Plots
00:37:06.0 Comparing Sequences
00:38:49.0 Comparing Sequences, Alignment (Example)
00:41:30.0 Comparing Sequence, Definition: Pairwise Alignment
00:43:24.0 Comparing Sequence, Scoring Scheme
00:47:08.0 Distance, Definition
00:48:21.0 Minkowski Metric, Definition: Minkowski Distance
00:49:32.0 Hamming Metric, Definition: Hamming Distance
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