Vorlesung Grundlagen der Bioinformatik, 26. Stunde

Nieselt, Kay , 14.06.2012

Table of Contents:

00:00:00.0 Gene Prediction in Prokaryotes: Typical Structure of Prokaryotic Genes
00:05:57.0 Gene Prediction in Prokaryotes: Coding for Genes, Proteins
00:08:33.0 ORF (Open Reading Frame) Prediction in Prokaryotes, ORF Definition
00:09:39.0 ORF (Open Reading Frame) Prediction in Prokaryotes, Problem
00:13:47.0 ORF (Open Reading Frame) Prediction in Prokaryotes, Geometric Distribution
00:17:00.0 Codon Usage
00:18:29.0 Codon Usage, Codon Usage Vector for Coding Regions of E. Coli (Example)
00:19:55.0 Codon Usage: In-Phase Hexamer Feature, Fifth-Order Markov Model
00:23:27.0 ORF Prediction Using Markov Models, First-Order Markov Model
00:28:00.0 Probabilistic Models
00:30:47.0 GeneMark
00:33:45.0 Glimmer (Gene Locator and Interpolated Markov ModelER)
00:37:53.0 Gene Prediction in Eukaryotes: Structure of a Eukaryotic Gene
00:40:42.0 Gene Prediction in Eukaryotes, Difficulties
00:43:14.0 Gene Prediction in Eukaryotes: Comparison of Gene Density, GC Content
Autoplay
Quality
Playbackrate
 Settings
     Settings
      timms player
      •  embed
      •  legal
      •  about
      based on Video JS 6.6.0

      Embedded timms Player
      Mode Size Settings
      iframe
      100%
      427 x 240
      640 x 360
      854 x 480
      autoplay
      mute
      start 0:00:00
      Sorry, video window to small to embed...

      Rechtliches und Haftungsausschluss
       

      Die Web-Anwendung timms player ist Bestandteil des Webauftritts der Universität Tübingen.

      Es gilt das Impressum der Universität Tübingen

      Im Besonderen gelten die Regelungen zu:

      • Externen Links
      • Haftungsauschluss
      • Urheberrecht

      Es ist gestattet, den timms player über die Funktion embed als iframe in eigene Webseiten zu intergrieren.

      Es ist untersagt, die über den Streamingdienst timms angebotenen Inhalte ohne ausdrückliche schriftliche Genehmigung der Autorinnen und Autoren zu kopieren, zu modifizieren, zu verwerten oder zu veröffentlichen.

      Für die Richtigkeit und Vollständigkeit der Inhalte wird keine Garantie übernommen (siehe Impressum). Die Verfügbarkeit des Dienstes wird nicht garantiert. Der Dienst kann jederzeit ohne Angabe von Gründen verändert oder eingestellt werden.

       

      Tübinger Internet Multimedia System
       

      Online seit November 1999

      Mehr als 6000 Medienobjekte aus Lehre, Forschung und Universität.

      Über 100.000 Begriffe auf der timeline recherchierbar.

      Komfortable Zitatfunktion, für wissenschaftlich korrektes Zitieren.

      Teilbar als Link, mit Email oder auf twitter.

      Embeddable Player.