Vorlesung Bioinformatik für Lebenswissenschaftler, 7. Stunde

Kohlbacher, Oliver ; Krüger, Jens , 15.06.2012

Table of Contents:

00:00:00.0 Vorlesung Bioinformatik für Lebenswissenschaftler, Sequenzdatenbanken (Vorlesungsüberblick)
00:01:18.0 FASTA-Format
00:02:31.0 Datenbanken, Definition
00:05:02.0 Sequenzdatenbanken
00:07:06.0 Sequenzdatenbanken: Primärdatenbanken, Sekundärdatenbanken
00:09:08.0 Sequenzdaten
00:10:59.0 Sequenzierkosten; Sequencing by Synthesis
00:14:39.0 NCBI (National Center for Biotechnology Information)
00:15:41.0 GenBank
00:19:26.0 GenBank, Web-Interface
00:20:00.0 GenBank, Wachstum
00:20:32.0 GenBank, Accession Number
00:21:27.0 GenBank (Beispiel)
00:23:28.0 Primärdatenbanken für Nukleotide
00:23:54.0 Primärdatenbanken, Hauptprobleme: Redundanz, Qualität
00:25:40.0 RefSeq, Nukleotid-Datenbank
00:26:27.0 Primärdatenbanken für Proteine
00:27:31.0 UniProt (Universal Protein Resource)
00:28:30.0 UniProtKB/Swiss-Prot
00:29:29.0 UniProtKB/Swiss-Prot und TrEMBL
00:30:09.0 neXtProt
00:31:30.0 UniProtKB/Swiss-Prot-Eintrag
00:33:27.0 RefSeq protein database
00:33:58.0 Sekundärdatenbanken
00:34:43.0 Datenbanken, Formate
00:36:20.0 ENTREZ, Suchmaschine des NCBI: Einstiegsseite, Datenbankauswahl
00:38:19.0 GenBank: Suche, Datensatzanzeige, graphische Anzeige des Genoms
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