Lecture Computational Proteomics and Metabolomics, 2. Lesson

Kohlbacher, Oliver , 14.10.2014

Table of Contents:

00:00:00 Proteomics
00:01:36 Protein
00:02:29 Proteomics, Typical Questions
00:04:26 Proteomics: Phenotypes, Signaling (Examples)
00:06:12 Proteomics: Protein Interaction, Protein Characterization, Protein Expression, Protein Localization
00:07:03 Proteomics, Applications
00:07:31 Metabolites
00:08:48 Metabolomics, The Big Picture
00:10:06 Metabolic Networks
00:11:58 Technologies: Chromatography, Mass Spectrometry
00:14:24 Shotgun Proteomics
00:15:45 HPLC-MS
00:16:24 Mass Spectrometry
00:17:20 Proteomics, Database Search
00:17:53 Omics Data, Growth (EBI Repositories)
00:19:29 Multi-Omics/Polyomics
00:20:02 Big-Data and Reproducible Science
00:21:32 High-Throughput Proteomics, Pipelines and Workflows
00:24:03 KNIME and OpenMS/TOPP: TOPP-Tools, Interoperability, PSI Standard Formats
00:27:25 OpenMS
00:28:57 KNIME (KoNstanz Information MinEr)
00:33:14 KNIME, OpenMS: Materials
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