Lecture Computational Proteomics and Metabolomics, 10. Lesson

Rurik, Marc , 18.11.2014

Table of Contents:

00:00:00 SILAC (Stable Isotope Labeling with Amino Acids in Cell Culture)
00:08:18 SILAC, Phosphor Proteomics
00:10:46 Spike-In SILAC
00:16:06 SILAC Mouse
00:18:27 Isobaric Labeling
00:25:02 Isobaric Labeling, Idea
00:25:47 Isobaric Labeling, Key Method: iTRAQ (isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation)
00:27:00 iTRAQ
00:30:26 iTRAQ (Example)
00:31:18 iTRAQ, Mixture
00:32:44 Quantitative Data - LC-MS Maps
00:35:15 Label-Free Quantification (LFQ)
00:37:09 LFQ, Analysis Strategy
00:40:20 Feature-Based Alignment
00:44:27 Feature Finding
00:46:34 Linear Alignment
00:47:19 Multiple Alignment (Example)
00:48:15 Quantification Strategies (Overview)
00:49:24 Lecture Computational Proteomics and Metabolomics, Learning Units 4A and 4B: Materials and References
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