Lecture Computational Proteomics and Metabolomics, 15. Lesson

Kohlbacher, Oliver , 09.12.2014

Table of Contents:

00:00:00 Lecture Computational Proteomics and Metabolomics: Peptide Identification I - Database Search
00:00:31 Lecture Computational Proteomics and Metabolomics: Isobaric Labeling (Recapitulation)
00:12:11 Peptide Database Search (Overview)
00:12:44 Peptide Identification
00:22:15 Product Ion Generation
00:23:58 Ion Series
00:28:35 b/y Ions in CID
00:29:31 Ion Series, Example (TESTPEPTIDEK)
00:31:42 Peptide Fragmentation, Neutral Losses
00:33:06 Peptide Fragmentation, Internal Fragments
00:34:59 Peptide Fragmentation, Noise in Tandem Spectra
00:36:02 Ion Types (Summary)
00:37:21 Database Search (Overview)
00:40:56 Database Search, Key Steps
00:41:59 Database Search, Step 1: Generate Candidates
00:42:44 Database Search, Step 2: Generate Theoretical Spectra
00:43:11 Database Search, Step 3: Align Spectra
00:43:57 Database Search, Step 4: Scoring of Peptide Candidates
Autoplay
Quality
Playbackrate
 Settings
     Settings
      timms player
      •  embed
      •  legal
      •  about
      based on Video JS 6.6.0

      Embedded timms Player
      Mode Size Settings
      iframe
      100%
      427 x 240
      640 x 360
      854 x 480
      autoplay
      mute
      start 0:00:00
      Sorry, video window to small to embed...

      Rechtliches und Haftungsausschluss
       

      Die Web-Anwendung timms player ist Bestandteil des Webauftritts der Universität Tübingen.

      Es gilt das Impressum der Universität Tübingen

      Im Besonderen gelten die Regelungen zu:

      • Externen Links
      • Haftungsauschluss
      • Urheberrecht

      Es ist gestattet, den timms player über die Funktion embed als iframe in eigene Webseiten zu intergrieren.

      Es ist untersagt, die über den Streamingdienst timms angebotenen Inhalte ohne ausdrückliche schriftliche Genehmigung der Autorinnen und Autoren zu kopieren, zu modifizieren, zu verwerten oder zu veröffentlichen.

      Für die Richtigkeit und Vollständigkeit der Inhalte wird keine Garantie übernommen (siehe Impressum). Die Verfügbarkeit des Dienstes wird nicht garantiert. Der Dienst kann jederzeit ohne Angabe von Gründen verändert oder eingestellt werden.

       

      Tübinger Internet Multimedia System
       

      Online seit November 1999

      Mehr als 6000 Medienobjekte aus Lehre, Forschung und Universität.

      Über 100.000 Begriffe auf der timeline recherchierbar.

      Komfortable Zitatfunktion, für wissenschaftlich korrektes Zitieren.

      Teilbar als Link, mit Email oder auf twitter.

      Embeddable Player.